1. Hệ quản trị cơ sở dữ liệu (FoxPro, Access, SQL Server, Oracle)
2. Cơ sở dữ liệu
3. Hệ hỗ trợ ra quyết định
4. Tin–Sinh học
5. Xử lý ngôn ngữ tự nhiên

Một số hướng nghiên cứu chính

1. Tin–Sinh học
2. Xử lý ngôn ngữ tự nhiên
3. Học máy

Tạp chí / kỷ yếu hội nghị quốc tế

1. Le,T.K.T., Hirose,O., Nguyen,L.A.T., Saethang,T., Tran,V.A., Dang,X.T., Ngo,D.L, Kubo,M., Yamada,Y., Satou,K., "Inference of domain-domain interactions by matrix factorization and domain-level features", International Journal of Functional Informatics and Personalised Medicine, Vol. 4, Nos. 3/4, 2014.
2. Nguyen,L.A.T., Dang,X.T., Le,T.K.T., Saethang,T., Tran,V.A., Ngo,D.L, Gavrilov,S., Nguyen,N.G., Kubo,M., Yamada,Y., Satou,K., "Predicting Βeta-Turns and Βeta-Turn Types Using a Novel Over-Sampling Approach", Journal of Biomedical Science and Engineering, Vol. 7, No. 11, pp. 927–940, 2014.
3. Tran,V.A., Hirose,O., Saethang,T., Nguyen,L.A.T., Dang,X.T., Le,T.K.T., Ngo,D.L, Gavrilov, S., Kubo,M., Yamada,Y., Satou,K., "D-IMPACT: A Data Preprocessing Algorithm to Improve the Performance of Clustering", Journal of Software Engineering and Applications, Vol. 7, No. 8, pp.639–654, 2014.
4. Nguyen,L.A.T., Hirose,O., Dang,X.T., Le,T.K.T., Saethang,T., Tran,V.A., Kubo,M., Yamada,Y., Satou,K., "Improving the Prediction of Protein-Protein Interaction Sites Using a Novel Over-Sampling Approach and Predicted Shape Strings", Annual Review & Research in Biology, Vol. 3, Issue 2, pp. 92–106, 2013.
5. Dang,X.T., Hirose,O., Saethang,T., Tran,V.A., Nguyen,L.A.T., Le,T.K.T., Kubo,M., Yamada,Y., Satou,K., "A novel over-sampling method and its application to miRNA prediction", Journal of Biomedical Science and Engineering, Vol. 6, No. 2A, pp. 236–248, 2013.
6. Dang,X.T., Hirose,O., Bui,D.H., Saethang,T., Tran,V.A., Nguyen,L.A.T., Le,T.K.T., Kubo,M., Yamada,Y., Satou,K., "A Novel Over-Sampling Method and its Application to Cancer Classification from Gene Expression Data", Chem-Bio Informatics Journal, Vol. 13, pp. 19–29, 2013.
7. Saethang,T., Hirose,O., Kimkong,I., Tran,V.A., Dang,X.T., Nguyen,L.A.T., Le,T.K.T., Kubo,M., Yamada,Y., Satou,K., "PAAQD: Predicting immunogenicity of MHC class I binding peptides using amino acid pairwise contact potentials and quantum topological molecular similarity descriptors", Journal of Immunological Methods, Vol. 387, Issues 1–2, pp. 293–302, 2013.
8. Saethang,T., Hirose,O., Kimkong,I., Tran,V.A., Dang,X.T., Nguyen,L.A.T., Le,T.K.T., Kubo,M., Yamada,Y., Satou,K., "EpicCapo: epitope prediction using combined information of amino acid pairwise contact potentials and HLA-peptide contact site information", BMC Bioinformatics 2012.
9. Tran,V.A., Clemente,J.C., Nguyen,D.T., Li,J., Dang,X.T., Le,T.K.T., Nguyen,L.A.T., Saethang,T., Kubo,M., Yamada,Y., Satou,K., "IMPACT: A Novel Clustering Algorithm based on Attraction", Journal of Computers, Vol. 7, No. 3, pp. 653–665, 2012.

Tạp chí / kỷ yếu hội nghị quốc gia

1. Le Thi Tu Kien and Nguyen Quynh Diep (2019) Improving predicted residue-residue contacts by filtering false positive samples, HNUE JOURNAL OF SCIENCE (Natural Sciences)   Volume 64, Issue 10, pp. 61-69
2. Nguyễn Thị Thủy, Lê Thị Tú Kiên (2018) Tích hợp và phân tích dữ liệu lớn trên hệ sinh thái Hadoop, Tạp chí Khoa học ĐHSPHN,  Vol. 63, No. 11A, pp. 21-29
3. Bộ môn Hệ thống thông tin và tri thức, "Application data warehouse technology in training management decision support", Tạp chí ĐHSPHN, 2008.

Sách chuyên ngành

1. Lê Thị Tú Kiên, Nguyễn Thị Kim Ngân, Nguyễn Thanh Tùng, "Bài tập thực hành Access", Nhà xuất bản ĐHSPHN, 2008.